Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms