Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Cnih4Q9CX13 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Cnih4Q9CX13 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Cnih4Q9CX13 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih4Q9CX13 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms