Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Mrpl35Q9CQL6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Mrpl35Q9CQL6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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