Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RTRAFQ9CQE8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms