Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms