Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMPDL3BQ92485 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms