Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Traf7Q922B6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Traf7Q922B6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms