Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d2Q8VD57 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d2Q8VD57 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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