Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApobrQ8VBT6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms