Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CipcQ8R0W1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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