Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pitrm1Q8K411 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms