Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Slfn5Q8CBA2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slfn5Q8CBA2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms