Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cnot2Q8C5L3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms