Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdcl3Q8BVF2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdcl3Q8BVF2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms