Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms