Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Pabpc2Q62029 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc2Q62029 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pabpc2Q62029 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Pabpc2Q62029 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc2Q62029 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Pabpc2Q62029 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Pabpc2Q62029 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Pabpc2Q62029 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc2Q62029 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc2Q62029 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pabpc2Q62029 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Pabpc2Q62029 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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Pabpc2Q62029 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Pabpc2Q62029 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Pabpc2Q62029 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pabpc2Q62029 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pabpc2Q62029 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pabpc2Q62029 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pabpc2Q62029 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pabpc2Q62029 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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