Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbbp4Q60972 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms