Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trp53i11Q4QQM4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trp53i11Q4QQM4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trp53i11Q4QQM4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trp53i11Q4QQM4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trp53i11Q4QQM4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trp53i11Q4QQM4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trp53i11Q4QQM4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trp53i11Q4QQM4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trp53i11Q4QQM4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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