Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Acsf3Q3URE1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acsf3Q3URE1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms