Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trafd1Q3UDK1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trafd1Q3UDK1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms