Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms