Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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