Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccbe1Q3MI99 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccbe1Q3MI99 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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