Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EXOSC9Q06265 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms