Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msx2Q03358 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msx2Q03358 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms