Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb4Q02738 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms