Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cbx1P83917 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cbx1P83917 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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