Protein–RNA interactions for Protein: P61750

Arf4, ADP-ribosylation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf4P61750 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf4P61750 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arf4P61750 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf4P61750 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms