Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

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Length 1,188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Itga11P61622 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga11P61622 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Itga11P61622 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Itga11P61622 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Itga11P61622 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itga11P61622 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms