Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctnnd1P30999 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms