Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TP20293 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TP20293 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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TP20293 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TP20293 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TP20293 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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