Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P18529 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18529 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18529 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18529 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18529 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18529 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18529 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18529 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18529 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18529 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18529 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18529 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18529 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18529 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18529 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18529 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18529 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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P18529 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18529 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18529 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms