Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxb1P17919 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms