Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Tnp1P10856 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms