Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Opn1mwO35599 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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