Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms