Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn1aA2APX8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms