Protein–RNA interactions for Protein: V9GXS8

Gm11983, Predicted gene 11983, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11983V9GXS8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm11983V9GXS8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms