Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C7

Prpf40a, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40aQ9R1C7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Prpf40aQ9R1C7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Prpf40aQ9R1C7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Prpf40aQ9R1C7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prpf40aQ9R1C7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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