Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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