Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Stx12Q9ER00 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx12Q9ER00 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms