Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Efhd1Q9D4J1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Efhd1Q9D4J1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Efhd1Q9D4J1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Efhd1Q9D4J1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Efhd1Q9D4J1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efhd1Q9D4J1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms