Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Batf3Q9D275 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms