Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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