Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CactinQ9CS00 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CactinQ9CS00 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms