Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ykt6Q9CQW1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms