Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms