Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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Chmp3Q9CQ10 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Chmp3Q9CQ10 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Chmp3Q9CQ10 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Chmp3Q9CQ10 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Chmp3Q9CQ10 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chmp3Q9CQ10 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Chmp3Q9CQ10 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Chmp3Q9CQ10 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Chmp3Q9CQ10 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Chmp3Q9CQ10 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Chmp3Q9CQ10 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Chmp3Q9CQ10 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms