Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdca3Q99M54 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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