Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ophn1Q99J31 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ophn1Q99J31 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms